皇帝的政治观念当是一致的，皇帝若想保守自然是选保守的人当内阁首辅，皇帝若想激进自然是选激进的人当内阁首辅。
同时，又因为内阁首辅掌控了官集团也可以更加容易凝聚官的力量推行新政，也可以去抗衡整个武官集团。
当然，这并不是说武官集团依旧会被官压制。
武官也有自己的央机构便是大元帅府。
大元帅府的最高统帅是皇帝本人。
而军队的指挥权与调兵权皆已由大元帅府控制，也意味着，武官打仗将不再听从兵部调配，武官也不再从属于官，即便是军队里的职人员也都只接受大元帅府的军令。
大元帅府的官员任命也不走内阁控制的吏部和兵部。
大元帅府有自己的组织部即总政治处。
但大元帅府没有除了皇帝外是没有最高统帅的，即便是枢密使此时也已被朱由检撤掉不再设立。
但大元帅府有自己的部门如同以前的六部衙门一样，事实相当于军0事委0员会，而朱由检是主席。
但都察院、大理寺、刑部即三法司是不隶属于内阁与大元帅府的。
但他却掌控了大明的立法权与司法权以及检察权，从某种意义来说，都察院、大理寺、刑部和内阁与大元帅府是并立的。
除皇帝本人外，任何一个帝国官员不可能在掌控部分军权的同时还掌控司法权以及检察权和行政权。
但大明并没有完全实现司法独立。
大元帅府内部还有军法官，而皇帝自己还有东厂和锦衣卫。
不过，朱由检正在努力让除了大元帅府内部犯罪人员交由三法司处理，但对大元帅府体系官员的监督则没有交给三法司而是交给了锦衣卫。
大元帅府体系的官员只能皇帝自己的人去监督其贪腐情况，即便是三法司的官也没有权力监督与羁拿大元帅府体系的官员，只能由锦衣卫羁拿再交给三法司后再
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